ふるさと納税の寄付の確定申告はetaxで申告することも可能です。国税庁のホームページに平成29年度の確定申告の特集があるので参考にしてください。
こちらです⇒http://www.nta.go.jp/taxes/shiraberu/shinkoku/tokushu/index.htm
ちなみにふるさと納税された方のための確定申告書作成の手引などは地方税ポータルシステムeltaxでPDFにしてあります。
こちら⇒https://www.eltax.jp/www/contents/1419405596536/
ちなみにさとふるというソフトバンクグループが運営しているふるさと納税のサイトでは普通に税務署で確定申告する方法とetaxで確定申告する方法の2つともわかりやすく図解入りで説明されているので詳しくはさとふるのホームページをみるのが良いと思います。
さとふるはこちら↓